Introduction des tests de dépistage en temps réel à la ferme
Bioenterprise Canada soutient le développement du laboratoire mobile de Harvest Genomics
Mis à jour en janvier 2024
Durant la pandémie, le dépistage facile des maladies à la maison est devenu monnaie courante chez les Canadiens grâce à la mise au point de tests rapides de dépistage de la COVID-19 à faire à la maison. Rémi Maglione envisage d’étendre cette méthode de dépistage conviviale aux agriculteurs afin qu’ils puissent détecter rapidement certaines maladies touchant leurs plantes.
Après avoir obtenu une première bourse d’entrepreneuriat Mitacs à l’Université du Québec à Montréal (UQAM) pour la biosurveillance des agents pathogènes aériens, et déterminée à démocratiser les solutions génomiques grâce au déploiement abordable de la technologie de séquençage par les nanopores, Harvest Genomics a lancé un nouveau projet de collaboration.
En collaboration avec des chercheurs du ministère de l’Agriculture, de l’Alimentation et des Affaires rurales de l’Ontario (MAAARO) et grâce à un financement de l’organisme Ontario Greenhouse Vegetable Growers, l’entreprise a commencé à mettre au point un test novateur par séquençage pour la détection précoce du virus du fruit rugueux brun de la tomate (ToBRFV) [en anglais seulement].
Le ToBRFV est un phytovirus qui touche les tomates et les poivrons. Découvert dans des serres de l’Ontario en 2019, il se propage rapidement avant l’apparition des symptômes. La détection précoce du virus grâce à la trousse d’écouvillonnage mise au point par Harvest Genomics est donc un élément important de l’intervention de l’industrie. L’entreprise compte maintenant des clients partout en Amérique du Nord [en anglais seulement].
Harvest Genomics mène aussi des travaux en métagénomique du sol afin d’aider les producteurs à mettre en œuvre des solutions durables, des principes d’agroécologie et la surveillance des pathogènes. Dans le cadre du projet SOYAGEN, l’entreprise collabore maintenant avec des semenciers pour accélérer le développement de cultures et de variétés afin de commercialiser plus rapidement et plus efficacement les nouvelles variétés de cultures. Cela requiert l’établissement de profils avec des marqueurs de haute densité ainsi que la prédiction génomique.
Grâce aux progrès technologiques, il est maintenant possible de prélever des échantillons complexes de sol ou d’eau et d’extraire et de séquencer l’ADN de chaque organisme simultanément. Dans le domaine des cultures en serre, M. Maglione souligne qu’un producteur peut ainsi envoyer un seul échantillon, à partir duquel Harvest Genomics pourra déterminer la présence du ToBRFV et d’une foule d’autres pathogènes.
Le financement du programme SmartGrowth de Bioenterprise Canada a soutenu la mise sur pied du laboratoire mobile de Harvest Genomics.
« Nous avions la plateforme de base, un laboratoire mobile, qui était prête pour la phase d’essai, et le financement de Bioenterprise a joué un rôle crucial dans l’optimisation des protocoles, la création d’un portail en ligne, la réalisation des tests et l’établissement des procédures pour la réalisation de ces tests dans des environnements commerciaux », explique M. Maglione.
« De plus, cette aide nous a permis de peaufiner le laboratoire mobile en y intégrant un élément crucial pour l’avenir : un système de rétention d’air. Cet appareil aux applications multiples permet, entre autres, de piéger des microorganismes et des spores, ainsi que des virus et des insectes présents dans l’air. Le soutien du programme a été déterminant pour faire passer le concept du stade théorique à celui de l’essai bêta réel », ajoute-t-il.
Dans l’entreprise privée, il est souvent difficile d’obtenir du financement pour la recherche et le développement. C’est pourquoi il est essentiel, souligne M. Maglione, que des organisations comme Bioenterprise Canada offrent du financement après la phase de découverte ainsi qu’une aide à la commercialisation.
« Des organisations comme Bioenterprise jouent un rôle essentiel en aidant à faire avancer les technologies au stade de démarrage; elles sont indispensables à la réussite », dit-il.
Bioenterprise Canada est le Réseau foodtech et agtech du Canada. Fort de deux décennies d’expérience au service de l’industrie, ce réseau national et international d’établissements de recherche, d’universitaires, de mentors et d’experts, de bailleurs de fonds et d’investisseurs, d’acteurs du gouvernement et de partenaires de l’industrie aide les petites et moyennes entreprises du secteur agroalimentaire, partout au pays, à connecter, à innover et à grandir.Pour obtenir plus d’information au sujet du programme SmartGrowth, consultez le site Web https://bioenterprise.ca/fr/programmes-2/programme-smartgrowth/ ou communiquez avec Alexandra Burdett en écrivant à l’adresse alexandra.burdett@bioenterprise.ca.
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